علی مطهری در نامه انتقادی به رئیس قوه قضاییه درباره مجازات مطهری‌پژوهی خواستار لغو این حکم در دادگاه تجدیدنظر شد.در نامه علی مطهری خطاب به حجت الاسلام غلامحسین محسنی اژه‌ای آمده است:«جناب حجت‌الاسلام آقای اژه‌ای دامت برکاته
رئیس محترم قوه قضائیه
با سلام و آرزوی توفیق برای جناب‌عالی، در خبرها آمده بود که خانم یلدا معیری، عکاس خبری، در دادگاه بدوی از جمله محکوم شده است به صد صفحه پژوهش درباره آثار استاد شهید آیت‌الله مطهری. البته نفس توجه به آثار آن اسلام‌شناس گرانقدر در شرایطی که نهادهای فرهنگی نظام مانند صداوسیما به‌رغم توصیه‌های مکرر و مؤکد امام خمینی و مقام رهبری توجهی به این آثار ندارند قابل‌تقدیر است، لکن استفاده از آن به‌عنوان مجازات و یک کار اجباری می‌تواند آثار منفی، هم در شخص محکوم و هم در جامعه داشته باشد چراکه مراجعه به این آثار باید از روی اختیار و انتخاب باشد.
مستدعی است ترتیبی اتخاذ فرمایید که این حکم در دادگاه تجدیدنظر لغو شود. قبلا از حسن توجه جناب‌عالی سپاسگزارم.
با تقدیم احترام
علی مطهری»
